Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC2Q9BYS8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC2Q9BYS8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms