Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDAC8Q9BY41 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms