Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms