Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms