Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSBP4Q9BWG4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms