Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2AFJQ9BTM1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms