Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCMBPQ9BTE3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms