Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms