Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPS6KC1Q96S38 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms