Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf72Q96LT7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf72Q96LT7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf72Q96LT7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf72Q96LT7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms