Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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