Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms