Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C18orf8Q96DM3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms