Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG2BQ96BY7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms