Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms