Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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TRIM63Q969Q1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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TRIM63Q969Q1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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TRIM63Q969Q1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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TRIM63Q969Q1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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