Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A1Q93096 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A1Q93096 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A1Q93096 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A1Q93096 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A1Q93096 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A1Q93096 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A1Q93096 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms