Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms