Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms