Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms