Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms