Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRSK1Q8TDC3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms