Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms