Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms