Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms