Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms