Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms