Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms