Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms