Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LRRC18Q8N456 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LRRC18Q8N456 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LRRC18Q8N456 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LRRC18Q8N456 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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LRRC18Q8N456 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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LRRC18Q8N456 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms