Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms