Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TRAPPC6BQ86SZ2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TRAPPC6BQ86SZ2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TRAPPC6BQ86SZ2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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