Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSSK4Q6SA08 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms