Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms