Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIRMAQ69YN4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms