Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms