Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms