Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms