Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF20Q5VT98 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms