Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms