Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms