Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms