Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms