Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms