Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms