Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms