Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms