Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms