Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF1Q3BBV0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms