Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETM2Q2VYF4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETM2Q2VYF4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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